Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp1P97350 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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