Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cux2P70298 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cux2P70298 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms