Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms