Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcbP68404 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms