Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hps5P59438 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms