Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csrnp3P59055 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csrnp3P59055 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csrnp3P59055 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csrnp3P59055 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms