Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp1P56183 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms