Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acod1P54987 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms