Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cux1P53564 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cux1P53564 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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