Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Map3k1P53349 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Map3k1P53349 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Map3k1P53349 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Map3k1P53349 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Map3k1P53349 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms