Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgd1P52734 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms