Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Upp1P52624 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Upp1P52624 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms