Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc13P50207 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms