Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmod1P49813 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms