Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Abcd1P48410 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms