Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VdrP48281 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VdrP48281 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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VdrP48281 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VdrP48281 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VdrP48281 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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