Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lig1P37913 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms