Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mmp13P33435 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Mmp13P33435 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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