Protein–RNA interactions for Protein: P32648

Vip, VIP peptides, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VipP32648 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VipP32648 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VipP32648 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VipP32648 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VipP32648 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms