Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NapbP28663 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NapbP28663 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NapbP28663 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NapbP28663 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NapbP28663 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NapbP28663 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NapbP28663 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NapbP28663 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NapbP28663 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NapbP28663 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NapbP28663 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NapbP28663 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NapbP28663 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NapbP28663 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NapbP28663 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms