Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U2af2P26369 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms