Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Aldh1a1P24549 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aldh1a1P24549 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms