Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3P21107 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms