Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VimP20152 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VimP20152 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VimP20152 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VimP20152 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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