Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18533 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18533 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18533 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P18533 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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