Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ptbp1P17225 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms