Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sptan1P16546 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sptan1P16546 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms