Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RaraP11416 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RaraP11416 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RaraP11416 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RaraP11416 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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