Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp1P11103 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms