Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CrygdP04342 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms