Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FosP01101 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FosP01101 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FosP01101 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FosP01101 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FosP01101 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FosP01101 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FosP01101 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms