Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vti1aO89116 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms