Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BlmO88700 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BlmO88700 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BlmO88700 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms