Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm10509O88255 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms