Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clk2O35491 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clk2O35491 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms