Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcc1O35379 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms