Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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ColqO35348 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ColqO35348 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ColqO35348 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ColqO35348 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ColqO35348 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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ColqO35348 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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