Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcns1O35173 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Kcns1O35173 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Kcns1O35173 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcns1O35173 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms