Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ArxO35085 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ArxO35085 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ArxO35085 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ArxO35085 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms