Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3239L7N2D9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm3239L7N2D9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3239L7N2D9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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