Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm9602J3QPD5 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms