Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim18J3QNP2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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