Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4930544D05RikJ3QK56 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930544D05RikJ3QK56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms