Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Farp1F8VPU2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Farp1F8VPU2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms