Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28305F6U473 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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