Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Syngap1F6SEU4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms