Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc71lE9Q4T4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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