Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms