Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms