Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3252E9PUT9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3252E9PUT9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms